案例一:miRNA 可以作为失重相关的 biomarker
研究背景
骨质流失是长期处于空间微重力环境下的航天员发生的典型生理改变,本研究的目的是想找到与失重相关的 miRNA,可以作为失重引发骨质流失的 biomarker。
研究内容
欧易生物携手中国航天员科研训练中心,通过 miRNA 芯片筛选与失重引发的骨质流失的 biomarker,其中 miRNA 芯片的筛选和分析工作由欧易生物完成。该研究中,首先收集 4 个志愿者 45 天 bed rest 前后的血浆样本进行 miRNA 芯片分析,并在 16 个样本中进行了差异 miRNA 验证。通过 ROC 曲线分析发现 miR-130a 等 10 个 miRNA 可以作为 HDTbed rest 诱导的生理变化的潜在标记。
图 1 | 技术路线
图 2 | 基于芯片筛选的 miRNA 表达热图
研究结果
1. 收集 4 个个体 45 天 bed rest 前后的血浆样本进行 miRNA 芯片分析,共筛选到 37 个下调 miRNAs 和 2 个上调miRNAs,且芯片与 qRT-PCR 定量结果基本一致。
2. 重新收集 16 个个体在 3 个时间点(45 天 bed rest 前、45 天 bed rest 后、恢复 10 天)的血浆样本进行 miRNA 验证。
3. ROC 曲线分析表明 miR-130a、miR-451a、miR-1234、miR-1290、miR-363、miR-20a、miR-151-5p、miR-151-3p、miR-103 和 miR-199a-3p 可能是 HDT bed rest 诱导的生理变化的潜在标记。采用 Pearson’s correla-tion 分析这些 miRNAs 与骨质流失的相关性,发现 miR-1234 与骨骼参数显著相关。
参考文献
Ling S, Zhong G, Sun W, et al. Circulating microRNAs Correlated with Bone Loss Induced by 45 days of BedRest. Front Physiol 2017; 8: 69. (IF: 4.031)