简化基因组甲基化测序

 
 
简化基因组甲基化测序——Methyl RAD
 
Methyl RAD技术(Wang et al,Open Biol,2015)使用甲基化修饰依赖性内切酶
如FspEI、MspJL、LpnPI、AspBHI等,此类内切聘识别DNA上发生甲基化的胞晓淀
在识别位置的下游隔一定距离切割双链
 
若DNA双链具有中心对称甲基化状态
则可以切割产生一个固定长度的双链DNA片段
 
对酶切产生的标签建库测序
即可进行甲基化位点的定性和相对定量分析
 
 

 

 

欧易特色
 
文库构建简便快速,不经过片段大小选择,保证了实验的重复性
具有极强的灵活性,标签密度可控
标签长度一致,PCR扩增效率一致,测序深度均一
具有单碱基分辨率,可以做到甲基化位点的定性和相对定量分析
 
甲基化位点检测的假阳性率能够控制在0.50%以内(WGBS假阳性率在0.28%-0.50%)
提供标准和高级生物信息分析,可根据客户需求提供个性化数据分析
所需的样本DNA起始量较低
有参无参物种均可,既可用于未知甲基化位点的开发,也可用于不同样本间的甲基化位点的差异研究
 
 

 

 

推荐测序模式
 
Hiseq X-Ten , PE150·30Mreads/1G基因组大小
 
数据分析内容
 
标准数据分析
 
 
高级数据分析
 
 
 
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